Validaçao do DNA Barcoding como identificador de espécies: um estudo de ampla amostragem com o gênero Pseudoplatystoma (Siluriforme, Pimelodidae) na Amazônia / Mauro de Freitas Ortiz.

Por: Ortiz, Mauro de FreitasColaborador(es):Alves Gomes, José Antônio | Hrbek, TomasDetalhes da publicação: Manaus: [s.n.], 2010Notas: xiv, 59 f. : il. (algumas color.)Assunto(s): Pseudoplatystoma | Genética de populaçoes | Marcadores genéticos | DNA Barcoding | PimelodidaeClassificação Decimal de Dewey: 597.520415 Recursos online: Clique aqui para acessar online Nota de dissertação: Dissertação (mestrado)-- INPA, Manaus, 2010. Sumário: O DNA Barcoding é uma metodologia na qual se pressupoe que um pequeno fragmento de DNA pode ser utilizado como um identificador padronizado e único, tal como um código de barras, para identificaçao de espécies, servindo tanto na identificaçao de espécies já descritas, como auxiliando na descoberta de novas espécies. O principal pressuposto para a sua efetividade é de que as divergências intraespecíficas sempre sejam menores que as interespecíficas, o que se chama de barcoding gap. A monofilia recíproca das espécies seria entao o principal determinante para a existência deste. Entre os fatores que irao determinar a existência da monofilia recíproca e conseqüentemente eficiência do DNA Barcoding estao a diversidade intraespecífica e a estruturaçao populacional. Poucos testes empíricos para avaliaçao do DNA Barcoding foram realizados no intuito de validá-lo. Neste trabalho foi usado um gênero de peixes neotropicais como modelo em testes de validaçao do DNA Barcoding. Num primeiro momento foi referendado um banco de dados que continha apenas sequências de amostras com referenciais em imagens. Este obteve 100% de identificaçao correta entre as identificaçoes a priori e o resultado da identificaçao a posteriori do DNA Barcoding. Desta forma podemos usar o DNA Barcoding para identificaçao a posteriori de amostras sem referenciais em imagens ou até mesmo de origem desconhecida com confiança. Entao, num segundo momento, foram acrescidas as sequências de amostras sem referências em imagens e o banco de dados somou 229 sequências. Este obteve 91,26% de identificaçao correta entre as espécies identificadas a posteriori pelas sequências e a identificaçao atribuída a priori. O aparente resultado de ineficiência do DNA Barcoding foi atribuído a erros de identificaçao a priori em virtude da confiabilidade do primeiro banco, aos altos valores de confiança que sustentam os clados nas árvores de distâncias e a clara presença do barcoding gap. Todas as espécies de Pseudoplatystoma mostraram-se monofiléticos e as divergências intraespecíficas sempre foram inferiores as interespecíficas, ou seja, foi verificado o barcoding gap em todos os casos. Desta forma, este trabalho contribui na validaçao da eficácia do DNA Barcoding na identificaçao de espécies, em especial de peixes.
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Dissertação T 597.520415 O77v (Percorrer estante(Abre abaixo)) Disponível 10-0388
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Dissertação T 597.520415 O77v (Percorrer estante(Abre abaixo)) Disponível 10-0387

Dissertação (mestrado)-- INPA, Manaus, 2010.

O DNA Barcoding é uma metodologia na qual se pressupoe que um pequeno fragmento de DNA pode ser utilizado como um identificador padronizado e único, tal como um código de barras, para identificaçao de espécies, servindo tanto na identificaçao de espécies já descritas, como auxiliando na descoberta de novas espécies. O principal pressuposto para a sua efetividade é de que as divergências intraespecíficas sempre sejam menores que as interespecíficas, o que se chama de barcoding gap. A monofilia recíproca das espécies seria entao o principal determinante para a existência deste. Entre os fatores que irao determinar a existência da monofilia recíproca e conseqüentemente eficiência do DNA Barcoding estao a diversidade intraespecífica e a estruturaçao populacional. Poucos testes empíricos para avaliaçao do DNA Barcoding foram realizados no intuito de validá-lo. Neste trabalho foi usado um gênero de peixes neotropicais como modelo em testes de validaçao do DNA Barcoding. Num primeiro momento foi referendado um banco de dados que continha apenas sequências de amostras com referenciais em imagens. Este obteve 100% de identificaçao correta entre as identificaçoes a priori e o resultado da identificaçao a posteriori do DNA Barcoding. Desta forma podemos usar o DNA Barcoding para identificaçao a posteriori de amostras sem referenciais em imagens ou até mesmo de origem desconhecida com confiança. Entao, num segundo momento, foram acrescidas as sequências de amostras sem referências em imagens e o banco de dados somou 229 sequências. Este obteve 91,26% de identificaçao correta entre as espécies identificadas a posteriori pelas sequências e a identificaçao atribuída a priori. O aparente resultado de ineficiência do DNA Barcoding foi atribuído a erros de identificaçao a priori em virtude da confiabilidade do primeiro banco, aos altos valores de confiança que sustentam os clados nas árvores de distâncias e a clara presença do barcoding gap. Todas as espécies de Pseudoplatystoma mostraram-se monofiléticos e as divergências intraespecíficas sempre foram inferiores as interespecíficas, ou seja, foi verificado o barcoding gap em todos os casos. Desta forma, este trabalho contribui na validaçao da eficácia do DNA Barcoding na identificaçao de espécies, em especial de peixes.

Área de concentração: Genética, Conservação e Biologia Evolutiva.

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