Identificação de genes potencialmente envolvidos na formação do edema labial na espécie Colossoma macropomum (Cuvier, 1818) (Characiformes : Serrasalmidae) / (Registro n. 3927)

000 -LEADER
fixed length control field 04029cam a2200265 a 4500
001 - CONTROL NUMBER
control field 0014306
003 - INDENTIFICADOR DO NÚMERO DE CONTROLE
Campo de controle BR-MnINPA
005 - DATA E HORA DA ÚLTIMA INTERVENÇÃO
Campo de controle 20190416134434.0
008 - CAMPOS FIXOS DE DADOS - INFORMAÇÕES GERAIS
fixed length control field 150812s2012 bl|||||||||||||||||por|u
082 ## - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER
CDD 597.5
Edição CDD 19
090 ## - NÚMERO DE CHAMADA
Classificação T 597.5
Cutter F151i
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL
Nome pessoal Fagundes, Daniel Barros
Fuller form of name Daniel Barros Fagundes
245 10 - TÍTULO PRINCIPAL
Título principal Identificação de genes potencialmente envolvidos na formação do edema labial na espécie Colossoma macropomum (Cuvier, 1818) (Characiformes : Serrasalmidae) /
Indicação de responsabilidade Daniel Barros Fagundes
260 ## - IMPRENTA
Lugar de publicação, distribuição, etc. Manaus:
Nome do editor, distribuidor, etc. [s.n.],
Data de publicação, distribuição, etc. 2012
300 ## - DESCRIÇÃO FÍSICA
Extensão xx, 61 f. :
Outros detalhes físicos il., color.
502 ## - NOTA DE DISSERTAÇÃO OU TESE
Nota de dissertação ou tese Dissertação
Tipo de grau (mestre) -
Nome da Instituição onde se graduou Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA,
Ano em que se graduou 2012
520 ## - NOTA DE RESUMO
Nota de resumo As oscilações periódicas no nível dos rios amazônicos conferem dinamicidade às características fisiográficas e limnológicas da bacia. Com frequência, essas oscilações levam a variações marcantes nas concentrações de oxigênio dissolvido na água que podem ser observadas ao longo de um único dia, impondo à ictiofauna contínuos ajustes comportamentais, bioquímicos, fisiológicos e morfológicos. Com o objetivo de compreender os mecanismos de formação da expansão labial, uma adaptação morfoanatômica comum a certos peixes da ordem Characiformes, foi proposta a análise em série da expressão gênica (SAGE) na Plataforma SOLiD™. Para isso, indivíduos da espécie Colossoma macropomum foram expostos à hipóxia aguda (0,3 mgO2/L), permanecendo o grupo controle em condições normais de oxigenação (7,0 mgO2/L). Em linhas gerais, os procedimentos práticos foram: (I) extração do RNA total do tecido labial; (II) preparo dos pools de amostras de RNA; (III) construção das bibliotecas SOLiD™ SAGE™; (IV) amplificação clonal in vitro das bibliotecas via ePCR; (V) enriquecimento das sequências amplificadas; (VI) sequenciamento; (VII) análises de bioinformática; e (VIII) categorização gênica. Dentre os resultados obtidos podemos destacar que mais de 115 milhões de tags foram sequenciadas e a partir delas foram obtidas 2,24 milhões de tags únicas. Após o alinhamento das tags únicas com as sequências de referência da espécie Danio rerio foi possível identificar 24014 genes, dos quais 51,24% (Log2FC ≤ -0,1) apresentaram redução e 42,77% (Log2FC ≥ 0,1) tiveram sua expressão aumentada durante as baixas tensões de oxigênio. A partir destes resultados foram selecionados 10 genes (HIF1A, ARNT, HIF1AN, VHL, VEGFC, VEGFR2, PLCG1, TRPC6, NOS1 e GUCY1A3) que participam direta ou indiretamente do aumento da permeabilidade microvascular, processo supostamente relacionado à formação do fenótipo em estudo. Sendo assim, propomos que a via metabólica para a expressão deste fenótipo inicia-se com a estabilização da proteína HIF1A e formação do heterodímero HIF1 após dimerização com a proteína ARNT. Em seguida, a proteína HIF1 se liga na região promotora do gene VEGFC estimulando sua transcrição. Depois de traduzida, a proteína VEGFC é reconhecida pelo receptor de membrana VEGFR2, que induz a síntese de DAG por meio da proteína PLCG1. A DAG promove a abertura dos canais catiônicos de membrana celular TRPC6, que facilitam o influxo de íons cálcio do meio extra para o intracelular. Este aumento na concentração de cálcio intracelular ativa a enzima NOS1 que passa a sintetizar NO, que por sua vez, ativa a enzima GUCY1A3, que converte GTP em GMPc, provocando o aumento dos níveis x intracelulares deste monofosfato. Como consequência ocorre a formação de vias transvasculares que permitem o extravasamento do plasma para a região intersticial, provocando o edema e a expressão do fenótipo em questão.
590 ## - NOTA LOCAL
Nota local Área de Concentração: Genética, Conservação e Biologia Evolutiva.
650 ## - ASSUNTO - TERMO TÓPICO
Cabeçalho tópico ou nome geográfico Colossoma macropomum
650 ## - ASSUNTO - TERMO TÓPICO
Cabeçalho tópico ou nome geográfico Tambaqui
650 ## - ASSUNTO - TERMO TÓPICO
Cabeçalho tópico ou nome geográfico Hipóxia aquática
700 ## - ENTRADA SECUNDÁRIA - NOME PESSOAL
Nome pessoal Val, Adalberto Luís
Termo relacionador Orientador
856 ## - LOCALIZAÇÃO E ACESSO ELETRÔNICO
Link http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1883
942 ## - ENTRADA ADICIONAL (KOHA)
Tipo de material Dissertação
Source of classification or shelving scheme
Exemplares
Item perdido Não pode ser emprestado Origem Número de chamada Tombo Tipo de material
    Biblioteca INPA T 597.5 F151i INPA.2015.24551 Livro

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